Dezynfekcja pomieszczeń powinna być przeprowadzana regularnie w każdej placówce medycznej. Częstotliwość przeprowadzania dezynfekcji pomieszczeń powinna zostać zwiększona w okresie wzmożonych zachorowań czyli np. w tak zwanych sezonach grypowych. Dezynfekcja pomieszczeń jest szczególnie ważna w czasie zagrożeń epidemiologicznych - wtedy to głównie skuteczność dezynfekcji pomoże ograniczyć rozprzestrzenianie się wirusa. 

Placówki medyczne takie jak szpitale, ośrodki zdrowia, gabinety lekarskie czy labolatoria powinny przeprowadzać regularną dezynfekcje pomieszczeń ponieważ to właśnie w tych miejscach najczęściej przebywają osoby chore, które pozostawiają po sobie ogromne ilości drobnoustrojów chorobotwórczych. Miejsca te stają się pokaźnym siedliskiem bakterii i wirusów, który może stanowić poważne zagrożenie dla osób o obniżonej odporności czyli chociażby osób starszych, którzy ze względu na liczne choroby są pod stałą opieką lekarza prowadzącego.

Takie zagrożenie może też powodować poważne konsekwencje zdrowotne dla noworodków oraz kilkuletnich dzieci, które pojawiają się w takich placówkach w celu wykonania szczepień czy badaķń kontrolnych. To samo tyczy się matek w ciąży, dla których takie skupiska bakterii mogą mieć wiele niebezpiecznych konsekwencji.  

Dlatego, aby nie narażać pacjentów o obniżonej odporności oraz zapobiegać rozprzestrzenianiu się wirusów ważne jest, aby dezynfekcja pomieszczeń oraz powierzchni szczególnie w placówkach medycznych była przeprowadzana regularnie. 

Istnieje kilka różnych metod dezynfekcji. Każdą z nich dzielą pewne różnice, dlatego każda z nich charakteryzuje się innymi wadami oraz zaletami. 

Najłatwiej dostępną, a co za tym idzie najbardziej popularną metodą dezynfekcji jest ta z użyciem preparatów biobójczych. Polega ona na użyciu specjalnych preparatów do czyszczenia wszystkich powierzchni, z którymi styczność miał pacjent. Ważnym jest, aby stosowane preparaty miały 70% stężenie alkoholu. Niższe stężenie będzie nieskuteczne w walce z drobnoustrojami. 

Metoda ta jest bardzo popularna ze względu na łatwą dostępność produktów oraz niski koszt. Preparaty biobójcze występują w wielu różnych formach, a ich opakowania zapewniają wygodny codzienny użytek. Biobójcze preparaty do dezynfekcji to płyny, które można zakupić w różnych opakowaniach. Najczęściej spotyka się je w formie płynu w opakowaniu wyposażonym w spryskiwacz. Dla bardziej przemysłowego użytku poleca się koncentraty, które można kupować w zbiorniczkach o pojemności kilku litrów, a następnie przygotowywać gotowy płyn kiedy zajdzie taka potrzeba oraz dopasowując jego zużycie do indywidualnych potrzeb. Rozwiązanie to pozwoli ograniczyć zużycie plastiku oraz jest bardziej ekonomiczne i zdecydowanie tańsze. 

Niektóre środki biobójcze występują również w formie żelu zamkniętego w butelkach z dozownikiem - te najczęściej w placówkach medycznych spotyka się w formie środka do czyszczenia dłoni. Dodatkowo żelowe środki do dezynfekcji są też często dostępne jako kieszonkowy środek do dezynfekcji. 

Inną formą występowanie biobójczych preparatów są chusteczki do dezynfekcji. Nawilżone płynem chusteczki nadają się do czyszczenia raczej niewielkich powierzchni. 

Metoda polegająca na użyciu preparatów biobójczych jest popularna ze względu na łatwą dostępność preparatów oraz ich stosunkowo niską cenę, jednak należy pamiętać, że ta metoda wymaga udziału człowieka i jest bardzo czasochłonna oraz pracochłonna. Niestety w przypadku takiej metody bardzo łatwo można też przeoczyć pewne powierzchnie co sprawia, że skuteczność takiej dezynfekcji niestety zalicza się do najniższych. W placówkach medycznych, w których codziennie zjawia się wielu pacjentów taka metoda nie zda egzaminu. 

Kolejną metodą dezynfekcji jest ozonowanie pomieszczeń. Ozon posiada udowodnioną skuteczność w walce z wirusami, bakteriami oraz innymi drobnoustrojami. Niestety jest on również szkodliwy dla ludzi, zwierząt czy roślin dlatego żadne z wymienionych nie powinno się znajdować w ozonowanym pomieszczeniu, zarówno w trakcie jego ozonowania jak i około doby po. Wysokie stężenie ozony jest zabójcze dla drobnoustrojów, a u człowieka może nieodwracalnie uszkodzić układ oddechowy i wzrokowy. Dlatego ozonowane pomieszczenia powinny być szczelnie zamknięte w trakcie oraz po zakończonej dezynfekcji. Skutkuje to wyłączeniem danego pomieszczenia z użytku na ponad dobę, co może utrudniać pracę w placówkach medycznych. 

Ozonowanie odznacza się wysoką skutecznością ponieważ oczyszcza nie tylko powierzchnie, ale też powietrze w pomieszczeniu ze znajdujących się tam drobnoustrojów. Niestety jednak wykorzystanie takiej metody należy do nie małych wydatków. Nie zaleca się stosowania maszyn ozonujących na własną rękę, a zatrudnienie specjalistów wiążę się z jeszcze większym wydatkiem. 

Najlepszą metodą zdają się więc być lampy bakteriobójcze. Lampy te generują promieniowanie UV-C, które jest wysoce skuteczne w eliminacji drobnoustrojów. Niestety fale UV-C są niebezpieczne dla ludzi oraz zwierząt - mogą podrażniać skórę oraz wzrok. Jednak dla bezpiecznego stosowania takich lamp wystarczy dopilnować, aby nikt nie znajdował się w dezynfekowanym pomieszczeniu. W zależności od powierzchni pomieszczenia oraz wydajności urządzenia dezynfekcja lampami może potrwać od kilkunastu minut do maksymalnie kilku godzin. Co pozwala na wygodną dezynfekcje pomieszczeń, gdy nie są one używane (np. w nocy) oraz nie wymaga pracy człowieka. Zakup takiej lampy wiąże się z jednorazowo wyższym kosztem niż zakup zwykłych środków biobójczych, jednak w porównaniu do pozostałych metod jest najmniej czasochłonny oraz pracochłonny.